Skyline 소프트웨어

Skyline 소프트웨어

연구 목적으로만 사용할 수 있습니다. 진단 절차에는 사용할 수 없습니다.

Skyline Software는 MRM (Multiple Reaction Monitoring) 및 풀 스캔(MS1 및 MS/MS) 정량 분석법을 구성하고 그에 따른 질량 분석기 데이터 결과를 분석하기 위한 Windows 클라이언트 애플리케이션입니다. 첨단 기술을 사용하여 대규모 단백질체학 연구를 위한 표적 분석법을 생성하고 반복해서 구체화하는 것이 목적입니다.

Skyline Software는 University of Washington의 MacCoss Lab에서 무료로    다운로드,할 수 있습니다.

Skyline 토론 »

개요

Skyline은 MRM 분석법을 구성하고 최적화하기 위한 종합 패키지입니다. 단백질과 펩타이드를 이전 결과에서 Skyline으로 로딩하거나 Microsoft Excel 또는 라이브러리 데이터에서 붙여 넣을 수 있습니다. 그런 다음 예측 알고리즘을 사용하여 각 펩타이드 별로 가장 적합한 전하 상태와 조각 이온을 수집 방법에 맞게 선택합니다. 사용자는 펩타이드와 전이 설정을 완벽하게 제어하고, 분석법, 표준물 또는 Scheduled MRMTM 어세이 분석법에 따라 전이 물질 수를 지정할 수 있습니다. 또한 파라미터 최적화를 설정하거나, 모든 크로마토그래피 설정이 포함된 템플릿 분석법을 검색할 수 있습니다.

많은 그래프 결과가 표시되고, 데이터가 수집되는 동안 데이터 이상 여부를 검사할 수 있는 강력한 도구가 제공되므로 장비 운영자는 문제를 조기에 식별할 수 있습니다. 스크리닝 해상도가 높은 Skyline은 10개 이상의 그래프 창에 유용한 정보를 동시에 표시하며, 선택 항목 변경에 따른 지연 시간 없이 해당 정보를 업데이트할 수 있습니다.

그림 1: QTRAP 시스템을 사용하여 생성된 MRM 데이터 탐색. 펩타이드 및 전이 물질이 왼쪽에 표시됩니다. 탐색 창에서 펩타이드 및 전이 물질을 클릭하면 해당 MRM 전이 및 MS/MS 데이터가 표시됩니다. 펩타이드 및 전이 물질 옆의 점은 신호 강도를 나타냅니다. 녹색은 강한 이온 신호를 나타내고, 노란색은 약한 이온 신호를 나타냅니다. 점이 없으면 해당 펩타이드 전이 물질을 수집하지 못했음을 나타냅니다.

 

Exploring QTRAP System MRM Data

 

 

그림 2: TripleTOF 시스템을 사용하여 생성된 고분해능 MRM (MRMHR) 데이터 탐색. 각각의 펩타이드에 의해 생성된 전구체 및 조각 이온의 고분해능 추출 이온 크로마토그램(XIC)이 생성되고 표시됩니다. 이 경우 각 펩타이드 및 조각 이온의 크로마토그래피 머무름 시간 및 강도가 동일한 펩타이드의 다른 조각 이온과 함께 표시되므로, 잠재적인 문제를 가진 조각 이온과 함께 최적의 조각 이온을 동정할 수 있습니다.

Exploring TripleTOF System MRM Data