XCMSplus 소프트웨어

연구 목적으로만 사용할 수 있습니다. 진단 절차에는 사용할 수 없습니다.

XCMSplus 소프트웨어는 비표적 대사체학 데이터 분석을 위한 강력한 솔루션으로, 머무름 시간 정렬, 특성 검출 및 일치뿐만 아니라 통계 분석을 사용하여 내부 표준물 없이 상향 및 하향 조절된 내인 대사산물을 동정합니다. 직관적인 가상화 도구와 분석물이 240,000개 이상 있는 데이터베이스로 백업되는 XCMSplus 소프트웨어는 매우 드문 대사산물도 높은 신뢰도로 동정할 수 있습니다.

  • 강력한 솔루션 한 개 - 통계 분석 도구를 통해 원시 데이터 프로세싱 및 머무름 시간 정렬을 결합하여 시료 세트에서 중요한 상향 및 하향 조절된 대사산물을 동시에 동정합니다.
  • 대화형 작업 영역 - 직관적인 단일 작업 영역을 통해 데이터 프로세싱과 가상화가 간소화됩니다.
  • 입증된 추적 기록 - 6000명 이상의 사용자가 가장 많이 인용하는 XCMS는 대사산물을 발견 및 동정하고 연구 수준을 한 단계 높여주는 대사체학 소프트웨어 패키지입니다.

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개요

XCMSplus는 비표적 대사산물 스크리닝에 최적화된 소프트웨어입니다. 통계 분석을 통해 원시 데이터 프로세싱과 머무름 시간 보정이 결합된 이 소프트웨어는 다양한 시료에서 내인 대사산물을 발굴 및 동정합니다.

간소화된 데이터 처리 및 가상화

XCMSplus 소프트웨어는 SCIEX LC/MS 및 LC/MS/MS *.wiff 데이터 파일을 직접 처리하여 특성을 검출하고 비교합니다. 작업 여러 개를 동시에 처리할 수 있는 이 소프트웨어를 사용하면 단일 대화형 작업 영역에서 작업 상태를 모니터링하고 결과를 검토할 수 있습니다.

Figure 1: XCMSplus 소프트웨어 작업 영역.

단일 대화형 작업 영역: 단일 대화형 작업 영역 내에서 작업 여러 개를 한 번에 제출하고 작업 상태를 모니터링합니다. 작업 영역 내에서 간편하게 추출 이온 크로마토그램, 스펙트럼 상세 정보, 대화형 플롯 및 통계 데이터 시각화 플롯에 액세스할 수 있습니

강력한 알고리즘 및 그래프

데이터 파일 수십 개에서 특성 수천 개를 동시에 정량 분석 및 동정하려면 원시 데이터를 생물학적 관련 결론으로 전환하는 강력한 알고리즘이 필요합니다. 따라서 데이터를 다양한 시각화 플롯 및 대화형 플롯에 표시할 수 있습니다.

기본 성분 분석(PCA) 결과: 오른쪽 그림에서는 기본 성분 분석을 통해 쥐의 세 가지 표현형(마름, 살찜 및 비만)의 데이터가 비교되었습니다. 표현형으로 군집화된 시료는 그룹 간에 차등적으로 조정된 대사산물이 있음을 나타냅니다.

Figure 2: XCMSplus software PCA results.

Figure 3: XCMSplus software Cloud Plot.

클라우드 플롯 결과: 클라우드 플롯에서는 시료군 간에 신호 강도가 변경되는 특성을 보여줍니다. 상향 조정된 특성은 플롯 상단에서 원으로 표시되고 하향 조정된 기능은 플롯 하단에서 원으로 표시됩니다. 여기서 크기와 색상 채도 정도는 특성의 (로그) 배수 변화에 따라 달라집니다. 검은색 윤곽선의 원은 METLIN 데이터베이스에서의 적중 횟수를 나타냅니다. 색이 밝거나 어두운 원은 p 값 유의성과 직접 연관됩니다. 클라우드 플롯은 완벽한 대화형입니다. 여기서 p 값, m/z 값 및 머무름 시간을 필터링하여 필터링 기준에 따라 특성을 추가하거나 삭제하여 표시할 수 있습니다.

METLIN 데이터베이스

METLIN 데이터베이스는 사용 가능한 질량, 화학 공식 및 구조 데이터와 함께 대사산물이 240,000종 이상 있는 라이브러리입니다. 또한 이러한 대사산물 수천 개의 고분해능 MS/MS 데이터가 포함되어 있으며, 새 사용자 데이터를 허용할 수 있습니다.

XCMSplus - 글로벌 대사체학 스크리닝에 최적화

일반적으로 글로벌 발굴 실험에 대용량 데이터 파일이 사용됩니다. XCMSplus 소프트웨어는 로컬 프로세싱 및 일괄 분석을 통해 프로젝트 완료 시간을 몇 주에서 며칠로 단축시킬 수 있습니다. 무제한 데이터 저장 용량, 무제한 데이터 공유 용량 및 로컬 데스크톱 패키지 보안 기능을 제공하는 XCMSplus는 대사체학 연구의 완벽한 솔루션입니다.