GenomeLab™ GeXP에서 프라이머 연장을 통해 1회 반응으로 SNP를 최대 10개까지 스코어링 또는 미지의 대립 유전자 발굴
유연한 SNP 연구
단일 염기 다형성(SNP)은 유전자 변이에 관여하는 중요한 요소로서, 알려진 모든 다형성의 약 80%를 차지하고 있고 인간 게놈에서의 밀도는 평균 염기 쌍 1000개당 염기 1개로 추정됩니다. SNP가 대부분 이대립인자(짧은 텐덤 반복(STR)보다 덜 유익함)지만 빈번하게 생성되고 돌연변이체에 대해 안정적이므로, 마커와 미지의 변이 간의 유전자 관성 불평형(LD)을 사용하여 질병 원인 돌연변이를 매핑하는 연관성 연구에 매우 적합합니다.
GenomeLab GeXP 유전자 분석 시스템은 SBE(Single Base Extension) 분석과 DNA 염기서열 분석 등 두 가지 방식으로 SNP를 분석합니다. GenomeLab 소프트웨어는 단일 또는 다중 SNP 산물에서 자동으로 크기를 배열하여 대립 유전자를 확정합니다. 소프트웨어는 STR 좌위와 유사한 메커니즘을 활용하여 SNP 좌위를 분석합니다.
프라이머 연장을 통한 SNP 스코어링
GeXP 시스템을 사용하면 템플릿 하나 또는 서로 다른 템플릿의 여러 부위에서 SNP를 동시에 분석할 수 있습니다. GenomeLab™ SNPStart 프라이머 연장 키트는 이 분야 표준인 단일 염기 프라이머 연장 기술을 기반으로 합니다. 1회 반응으로 SNP를 최대 10개까지 다중 분석할 수 있도록 밸리데이션되고 최적화된 SNPStart 키트는 처리량이 낮거나 중간인 분야에 적합합니다. SNP 유전형질 분석은 SNP 좌위 태그를 자동으로 할당하는 GeXP 시스템의 단편 분석 소프트웨어를 통해 요약되고 보고됩니다.
GenomeLab SNPStart 프라이머 연장 키트를 사용한 다중 SNP 스코어링 분석
결과와 관련 있는 모든 파라미터를 간편하게 사용할 수 있어 데이터를 손쉽게 검토할 수 있습니다. Electropherogram을 겹칠 수 있어 편리하게 데이터를 비교할 수 있습니다.
대립 유전자를 크기 또는 크기와 색상 조합 별로 동정할 수 있어 간소화된 준비로도 SNP를 동정할 수 있습니다.
염기서열을 통한 SNP 발굴
DNA 염기서열은 미지의 대립 유전자를 발굴할 수 있는 주요 방법입니다. GeXP 유전자 분석 시스템은 DTCS(Dye-Terminator Cycle Sequencing)를 사용하여 효과적이면서 강력한 DNA 염기서열 프로토콜을 제공합니다. 미지의 시료 염기서열을 표준 염기서열에 정렬시키고 SNP가 있는 좌위를 동정합니다.
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