Skyline은 MRM 분석법을 구성하고 최적화하기 위한 종합 패키지입니다. 단백질과 펩타이드를 이전 결과에서 Skyline으로 로딩하거나 Microsoft Excel 또는 라이브러리 데이터에서 붙여 넣을 수 있습니다. 그런 다음 예측 알고리즘을 사용하여 각 펩타이드 별로 가장 적합한 전하 상태와 조각 이온을 수집 방법에 맞게 선택합니다. 사용자는 펩타이드와 전이 설정을 완벽하게 제어하고, 분석법, 표준물 또는 Scheduled MRMTM 어세이 분석법에 따라 전이 물질 수를 지정할 수 있습니다. 또한 파라미터 최적화를 설정하거나, 모든 크로마토그래피 설정이 포함된 템플릿 분석법을 검색할 수 있습니다.

많은 그래프 결과가 표시되고, 데이터가 수집되는 동안 데이터 이상 여부를 검사할 수 있는 강력한 도구가 제공되므로 장비 운영자는 문제를 조기에 식별할 수 있습니다. 스크리닝 해상도가 높은 Skyline은 10개 이상의 그래프 창에 유용한 정보를 동시에 표시하며, 선택 항목 변경에 따른 지연 시간 없이 해당 정보를 업데이트할 수 있습니다.

그림 1: QTRAP 시스템을 사용하여 생성된 MRM 데이터 탐색. 펩타이드 및 전이 물질이 왼쪽에 표시됩니다. 탐색 창에서 펩타이드 및 전이 물질을 클릭하면 해당 MRM 전이 및 MS/MS 데이터가 표시됩니다. 펩타이드 및 전이 물질 옆의 점은 신호 강도를 나타냅니다. 녹색은 강한 이온 신호를 나타내고, 노란색은 약한 이온 신호를 나타냅니다. 점이 없으면 해당 펩타이드 전이 물질을 수집하지 못했음을 나타냅니다.

그림 2: TripleTOF 시스템을 사용하여 생성된 고분해능 MRM (MRMHR) 데이터 탐색. 각각의 펩타이드에 의해 생성된 전구체 및 조각 이온의 고분해능 추출 이온 크로마토그램(XIC)이 생성되고 표시됩니다. 이 경우 각 펩타이드 및 조각 이온의 크로마토그래피 머무름 시간 및 강도가 동일한 펩타이드의 다른 조각 이온과 함께 표시되므로, 잠재적인 문제를 가진 조각 이온과 함께 최적의 조각 이온을 동정할 수 있습니다.