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클라우드 기반 질량 분석 소프트웨어
바로 사용할 수 있는 클라우드 기반 소프트웨어의 성능을 사용하면 단일 플랫폼에서 단백질체학, 대사체학 및 유전체학에서 생성된 빅 데이터로 질량 분석법을 밝혀내고 시각화할 수 있습니다. 데이터를 생물학적 정보로 신속하게 변환하고 결과를 간편하게 여러 동료들과 공유할 수 있습니다.
클라우드 컴퓨팅을 사용하여 빅 데이터를 의미 있는 정보로 변환합니다.
구성
데이터를 액세스하고 관리합니다. 데이터 수집에서 실험을 만듭니다. 메타데이터 정의를 통해 데이터를 설명합니다.
동정
펩타이드 동정과 단백질 간섭을 수행합니다. 동정 결과와 관련 분석을 검토합니다.
정량화
정량 분석 데이터를 분석하고 의미 있는 결과로 어셈블합니다. 정량 분석 결과와 관련 분석을 검토합니다.
해석
정렬 및 집락화를 통해 다중 오믹스 결과를 살펴봅니다. 강력한 탐색 도구를 통해 생물학적 정보를 얻습니다.
Experiments Manager
Proteomics
Metabolomics
BioReviews
iTRAQ
ProteinPilot
클라우드 기반 질량 분석
신속, 안전, 공유
클라우드 기반 소프트웨어의 발전으로 연구자들은 빅 데이터를 이전보다 빠르게 해석할 수 있게 되었습니다. OneOmics 제품군에 통합된 클라우드 컴퓨팅은 한 곳에서 모든 전사체학과 질량 분석 데이터로부터 다중 오믹스 데이터를 분류할 수 있습니다.
보다 빠르게 분석
처리하기 위해 시료의 대기열과 백로그를 기다릴 필요가 없으며 놀라운 속도로 정밀한 정보를 안전하게 가져올 수 있습니다.
- 데스크톱 처리에 비해 최대 10배 빠름
- 성능 손실 없이 다양한 분석물 동시에 처리
- 대규모 데이터 처리가 가능한 사용자 친화적인 앱 환경
- 단일 환경 내에서 워크플로우를 만들 수 있는 통합 도구
안전하게 저장 및 관리
최고의 보안 프로토콜이라는 자신감과 확신을 가지고 데이터를 처리할 수 있습니다. 간편하게 연구를 관리하고 결과를 구성하여 실험실 구성에 반영할 수 있습니다.
- Amazon Web Services(AWS) 보안 표준, 다중 사이트 동기식 스토리지
- 데이터를 장비에서 클라우드 환경으로 안전하게 전송
- 온사이트 스토리지와 컴퓨팅 성능에 대한 필요성 감소
공유 및 공동 작업
성능과 충실도로 공유된 타임라인에서 간편하게 통신하고 데이터를 처리할 수 있으므로 OneOmics 제품군을 통해 동시에 공동 작업을 진행할 수 있습니다. 관련된 모든 당사자들은 로그인하여 시작하기만 하면 됩니다.
- 간편하게 프로젝트 공유(데이터 및 결과)
- 더 이상 FTP 사이트를 사용하거나 하드 드라이브를 들고 다닐 필요가 없음
- 언제 어디서나 데이터와 결과에 액세스
클라우드 하나. 무수한 기회.
생산성 증가
더 많은 시료를 처리하고 더 많은 결과를 가져옵니다. SCIEX의 클라우드 기반 질량 분석 데이터 처리를 사용하면 많은 양의 데이터를 동시에 분석할 수 있으므로 실험실 생산성이 크게 향상됩니다.
강력한 시각적 개체
모든 오믹스 방식을 동시에 살펴보면서 다양한 방법으로 데이터를 시각화하므로 연구와 자금 제안을 우선적으로 진행할 수 있습니다.
확장성
OneOmics 제품군을 사용하면 자체 인프라를 사용하지 않고도 언제 어디서나 모든 크기의 데이터를 처리할 수 있습니다. 클라우드에서 작업하면 프로젝트 한계가 없어집니다.
속도
클라우드 기반 처리로 한 번에 여러 소스에서 데이터를 실행하고 분류할 수 있습니다. 처리하기 위해 시료의 대기열과 백로그를 기다릴 필요가 없으며 놀라운 속도로 정밀한 정보를 안전하게 가져올 수 있습니다.
빠른 설치
클라우드 기반 소프트웨어로, 설치가 간편합니다. 추가 시간이나 비용이 없으며 데이터 처리와 저장에도 문제가 없습니다. 간단히 월간 결제만 하면 원격으로 업데이트됩니다.
제품군 구독
실험실 분석과 연구에 가장 적합한 구독을 선택할 수 있습니다.
PROTEOMICS(단백질체학)
단백질체학 응용 분야를 위한 최고의 구독:
ProteinPilot 앱을 사용한 IDA 데이터 처리로 단백질 동정 및 이온 라이브러리 생성
SWATH Acquisition 데이터 처리로 상대적 정량 분석 가능
결과 시각화: 배수 변화 히트 맵, 화산 도표, 유전자 온톨로지 플롯 등
UniProt 기술 자료 및 reactome.org 경로 데이터베이스를 사용하여 경로 분석
다음이 제공됩니다.
데이터 및 결과에 사용되는 데이터 저장소 계정(4 TB 공간 포함)
- 4 GB마다 시료 약 1,000개
시료 약 1,000개에 대한 처리 시간 할당
휴대전화, 이메일 및 웹사이트를 통한 기술 지원
METABOLOMICS(대사체학)
대사체학 응용 분야를 위한 최고의 구독:
Accurate Mass 대사산물종 라이브러리(AMMSL) SWATH Acquisition 데이터 처리로 상대적 정량 분석 가능
SWATH Acquisition 데이터 처리로 상대적 정량 분석 가능
결과 시각화: 배수 변화 히트 맵, 화산 도표 등
인간 대사체 데이터베이스(HMDB) 및 reactome.org 경로 데이터베이스를 사용하여 경로 분석
다음이 제공됩니다.
데이터 및 결과에 사용되는 데이터 저장소 계정(3 TB 공간 포함)
- 1 GB마다 시료 약 3,000개
시료 약 3,000개에 대한 처리 시간 할당
휴대전화, 이메일 및 웹사이트를 통한 기술 지원
MULTI-OMICS(다중 오믹스)
다중 오믹스 연구자들을 위한 최고의 구독:
ProteinPilot 앱을 사용한 IDA 데이터 처리로 단백질 동정 및 이온 라이브러리 생성
대사체학을 위한 Accurate Mass 대사산물종 라이브러리(AMMSL)
SWATH Acquisition 데이터 처리로 상대적 정량 분석 가능
결과 시각화: 배수 변화, 화산 도표 및 다양한 플롯
UniProt 기술 자료, HMDB 및 reactome.org 경로 데이터베이스를 사용하여 경로 분석
다음이 제공됩니다.
데이터 및 결과에 사용되는 데이터 저장소 계정(6 TB 공간 포함):
- 4 GB마다 단백질체학 시료 약 1,000개
- 1 GB마다 대사체학 시료 약 2,000개(또는 유사한 조합)
단백질체학 시료 약 1,000개 및 대사체학 시료 약 2,000개(또는 유사한 조합)에 대한 처리 시간 할당
휴대전화, 이메일 및 웹사이트를 통한 기술 지원
호환성
SCIEX의 QTOF 시스템 포트폴리오는 현재와 미래에 실행해야 하는 분석법에 놀라운 속도, 내구성 및 정확성을 제공합니다.
응용 자료 및 유용한 정보
20시간 내에 SWATH Acquisition용 스펙트럼 라이브러리 생성
OneOmics 제품군과 TripleTOF 6600+ LC-MS/MS 시스템 사용
고처리량 SWATH Acquisition 솔루션을 사용하여 신속하게 정량 단백질체학 진행
TripleTOF 6600+ 시스템의 OptiFlow Turbo V 소스와 클라우드 처리를 사용하는 마이크로플로우 LC
인간 배아 신경 줄기 세포 분화에 대한 다중 오믹스 분석
OneOmics 제품군을 사용하여 클라우드에서 SWATH Acquisition 데이터 처리
클라우드 기반 처리 파이프라인을 사용하여 대사체학 SWATH Acquisition 데이터를 신속하게 분석 및 해석
SCIEX ZenoTOF 7600 시스템과 함께 OneOmics 제품군 사용
Zeno MS/MS를 사용하여 동정된 단백질 40% 이상 증가
OptiFlow 이온 소스가 포함된 ZenoTOF 7600 시스템과 클라우드에서 OneOmics 제품군 사용
SCIEX 커뮤니티
토론에 가입
SCIEX 계정을 만들면 SCIEX에서 제공하는 다양한 커뮤니티에 가입할 수 있습니다. 이러한 커뮤니티는 아이디어를 공유 및 교환하고 연구를 확장할 수 있도록 전 세계 동료들과 교류하는 플랫폼입니다. 또한 소프트웨어, 질량 분석법, 모세관 전기영동 및 기타 SCIEX 제품들의 새로운 혁신에 대한 최신 정보를 얻을 수 있습니다.
지질체학 커뮤니티
지질체학 동료 연구자들과 관계를 맺고 SCIEX의 지질 전문가에게 질문할 수 있습니다.
대사체학 커뮤니티
대사체학 분석에 대한 최신 토론 내용을 검색할 수 있습니다.
단백질체학 커뮤니티
가입하면 단백질체학의 질문과 주제에 대한 유용한 정보를 얻을 수 있습니다.
소프트웨어 커뮤니티
연구를 강화하는 힌트와 팁에 대해 질문하고 찾을 수 있습니다.
Experiments
Proteomics
Metabolomics
BioReviews
iTRAQ
ProteinPilot
Experiments
구성 및 만들기
Experiments(실험)
ORGANIZE(구성)
이 작업 공간에서 연구의 메타데이터를 어셈블하고 정의할 수 있습니다.
- 업로드한 데이터에서 실험 구축
- 데이터 및 결과와 같은 프로젝트 공유
- 연구 수준 메타데이터 할당
- 실험 구축 및 연구에 추가
- 단백질체학 SWATH Acquisition 데이터
- 대사체학 SWATH Acquisition 데이터
- RNA 발현 데이터
- 단백질 동정 데이터
- iTRAQ 시약 단백질 발현 데이터
- 메타데이터 할당에 사용할 수 있는 템플릿
CLOUD STORAGECLOUD STORAGE(클라우드 스토리지)
- SCIEX를 통해 클라우드에 업로드한 데이터를 액세스 및 관리
- 처리된 결과 파일 저장
- 동료들과 파일 공유
ProteinPilot
단백질을 보다 빠르게 동정 및 정량화
ProteinPilot
IDENTIFY(동정)
이 작업 공간을 사용하면 데이터 종속 수집(DDA) 데이터를 처리할 수 있습니다. Paragon 알고리즘과 Pro Group 알고리즘을 사용하여 데이터베이스를 검색할 수 있습니다. 단백질을 동정하고 이온 라이브러리를 확장할 수 있습니다.
단백질 동정
- "multi-file" 검색 처리
- "per-file" 검색 처리
결과 보기
- 데이터베이스 검색 결과 메트릭 보기
- 단백질 동정 결과 보기
- 일치하는 이온이 있는 MS/MS 데이터 보기
분석으로 기본 데이터 품질 평가
- 중요한 오류 발견율(FDR) 값에서 동정된 단백질과 펩타이드 수 보기
- 크로마토그래피와 소화 품질 평가
- 각 패널을 자세히 살펴봐 더욱 자세한 정보 검색
- 동정된 후 사용하지 않는 단백질 점수에 따라 정렬된 단백질 보기
Proteomics
정량화 및 시각화
Proteomics(단백질체학)
QUANTIFY(정량화)
이 작업 공간에는 연구와 SWATH Acquisition 데이터 처리에 추가 도움이 되도록 여러 애플리케이션이 포함되어 있습니다.
추출기 애플리케이션 기능에는 다음이 포함됩니다.
- 병합 및 머무름 시간(RT)을 선택한 이온 라이브러리에 할당
- 각 SWATH Acquisition 파일에서 RT 보정 수행
- 최종 이온 라이브러리를 사용하여 조각 이온 추출 이온 크로마토그램(XIC) 영역 추출 및 통합
- 오류 발견율(FDR) 분석을 위해 펩타이드 피크 그룹 점수 매기기
어셈블러 애플리케이션 기능에는 다음이 포함됩니다.
- 피크 영역 테이블을 동일한 규모의 모든 실험에 맞게 조정하는 정규화
- 펩타이드의 방향, 크기 및 확신과 단백질 배수 변화를 결정하는 배수 변화 분석
VISUALIZE(시각화)
Analytics(분석) 대시보드
질량 분석 단백질체학 데이터 품질을 시각화합니다.
- 재현성
- FDR 분석
- 머무름 시간 보정
- 다이내믹 레인지
Browser(브라우저) 대시보드
단백질 발현 결과를 선명하고 간결한 형식으로 시각화합니다.
- 시료 군집화
- 정규화 품질
- 온톨로지
- 단백질 배수 변화
- 상자 그림
- 단백질 서열에서 펩타이드 배수 변화
단백질 히트 맵
단백질 히트 맵 기능은 단백질 발현 결과를 간략하게 보여줍니다. 이 사용자 친화적인 형식을 통해 운영자는 필터를 조정하여 히트 맵을 구체화할 수 있습니다. 방대한 데이터 수집을 통해 단일 단백질을 분류하여 서열 전체에서 시료 변화를 확인할 수 있습니다.
Metabolomics
정량화 및 시각화
Metabolomics(대사체학)
QUANTIFY(정량화)
이 작업 공간에서 수집된 데이터로부터 주요 대사체학 영역을 밝혀낸 후 배수 변화(FC)와 확신을 정규화하고 컴퓨팅할 수 있습니다. 또한 MS 데이터 품질을 평가하고 연구에 대한 변화를 시각화할 수 있습니다.
이 작업 공간 내에서 추출기는 Accurate Mass 대사산물종 라이브러리(AMMSL)를 사용하여 화합물 피크를 추출하고 통합합니다.
또 다른 기능은 어셈블러 기능입니다. 이 기능은 피크 영역 테이블을 모든 실험의 규모에 맞게 조정합니다.
또한 이 작업 공간에서 배수 변화(FC) 분석도 지원하므로 대사산물 FC의 방향, 크기 및 확신을 결정할 수 있습니다.
VISUALIZE(시각화)
Analytics(분석) 대시보드
질량 분석 대사체학 데이터 품질을 시각화합니다.
- 재현성
- FDR 분석
- 다이내믹 레인지
Browser(브라우저) 대시보드
대사산물 발현 결과를 선명하고 간결한 형식으로 시각화합니다.
- 시료 군집화
- 정규화 품질
- 온톨로지
- 대사산물 배수 변화
- 상자 그림
- 시료에서의 대사산물과 변형 피크 영역
대사산물이 히트 맵 변화
대사산물 히트 맵에서 필터를 조정하여 플롯을 상세 검색할 수 있으므로 연구 내 대사산물 변화가 간략하게 표시됩니다. 포괄적인 데이터를 수집 및 처리하면 단일 분석물을 분류하여 서열 전체에서 시료 변화를 확인할 수 있습니다.
iTRAQ
표지 처리된 정량 분석
iTRAQ
이 작업 공간을 사용하면 다중화된 아민별 안정동위원소 iTRAQ 시약 키트를 사용하여 표지 처리한 시료에서 수집한 정량 데이터를 조사할 수 있습니다.
- "per-file" 또는 "multi-file" 검색 중 하나를 사용하여 단백질 동정 및 처리
- iTRAQ 시약을 사용한 정량화
- 편차 보정
- 정규화
- 백그라운드 보정
- 작업 공간 구축
-
- 데이터베이스 검색 결과 메트릭 보기
- 단백질 동정 결과 보기
- 일치하는 이온이 있는 MS/MS 데이터 보기
- 그룹 파일 다운로드 및 ProteinPilot 작업 공간에서 보기
BioReviews
다중 오믹스 연구 통합
BioReviews
서로 다른 오믹스 연구를 비교하고 평가할 수 있습니다. BioReviews 내에서 유전체학, 단백질체학 및 대사체학 실험 간에 정량 분석 데이터를 비교할 수 있습니다.
유전체학 및 단백질체학 결과를 할당하거나 다중 단백질체학 또는 다중 대사체학 데이터 집합을 비교할 수 있는 기능이 포함되어 있습니다.
- 연구를 결합하여 빅 데이터 할당
- 집락 분석과 추이 분석을 수행하여 단백질, 대사산물 또는 RNA 정량 분석 데이터에서 주요 유사점과 차이점을 찾을 수 있습니다.
- 유사점과 차이점에 대한 생물학적 유의성을 결정할 수 있습니다.
- 풍부한 생물학적 경로 보기
이 작업 공간의 또 다른 기능은 단백질이 여러 유전자에 위치하거나 단일 유전자가 여러 단백질에 위치할 때 수동 충돌 분해능을 지원하는 기능입니다.
또한 여러 실험에서 다중 분석을 수행할 수 있으며 이러한 분석은 각각 타일로 표시되고 사용한 설정과 결과에 대한 링크를 볼 수 있습니다.
- 교차점: 모든 PCA-PCVG 및 K-평균 군집화 간의 겹침을 보여줍니다.
- K-평균: 발견된 집락을 보여줍니다.
- PCA-PCVG: 발견된 추이를 보여줍니다.
- PCA-DA PCA: 알고 있는 시료 군집화 고려
- T-테스트: 모든 콘트라스트에서 log2 배수 변화와 확신 또는 -log10(p-값)을 비교한 플롯을 표시합니다.
- 영역 및 배수 변화 분석
